与此同时，宫外的凌风等人在陷入重围后，局势愈发危急。就在他们快要支撑不住时，远处突然传来一阵马蹄声，竟是女将秦昭云的援军赶到。这些援军如猛虎下山般冲入黑衣人阵中，局势瞬间逆转。黑衣人见势不妙，纷纷四散而逃。凌风等人乘胜追击，终于将黑衣人一网打尽。
凌风带着众人回到宫中，向嘉靖帝复命。嘉靖帝听了凌风等人的汇报，心中大喜：“此次多亏了你们，严党阴谋虽险，但终究未能得逞。朕命你们继续追查，将严党余孽全部肃清！”凌风等人齐声领命，一场更大的风暴，即将在-凌风、林清芷、李策和秦昭云领命后，不敢有丝毫懈怠，立刻展开对严党余孽的全面追查。他们根据之前收集的线索，顺藤摸瓜，一个个严党成员浮出水面。
凌风亲自率人前往工部，将工部尚书及一众涉事官员一网打尽。在工部尚书的书房暗格中，他们又发现了大量与严党勾结的书信，其中详细记录了严党如何谋划破坏神机营火器、操纵福建水师哗变等阴谋，甚至还有与倭寇、鞑靼等外敌勾结的往来信件。
李策则带领水鬼在京城各大钱庄展开调查，发现严党通过钱庄转移了大量的钱财，准备在阴谋败露后逃亡海外。李策顺藤摸瓜，找到了严党在钱庄的联络人，从他口中得知了严党其他成员的藏匿地点。
林清芷凭借着自己的医术和对药理的精通，在太医院中揪出了为严党效力的御医。这些御医不仅参与了毒害皇后娘娘的阴谋，还曾在军中使用药物削弱士兵战斗力，致使边疆战事屡屡失利。
秦昭云则率玄甲骑在京城内外巡逻，防止严党余孽狗急跳墙，发动叛乱。同时，她还派人密切监视着严府，防止有人趁乱转移罪证。
随着调查的深入，严党的势力逐渐被连根拔起。朝堂之上，往日里依附严党的官员们人人自危，纷纷上书弹劾严党，以求自保。嘉靖帝见此情景，雷霆震怒，下令将所有严党成员一律严惩，绝不姑息。
在凌风等人的努力下，严党终于被彻底肃清。京城百姓听闻此消息，无不拍手称快。嘉靖帝为嘉奖凌风等人的功绩，在宫中设宴款待众人。宴会上，嘉靖帝亲自为凌风等人敬酒：“此次能破获严党阴谋，诸位居功至伟。朕特封凌风为镇国将军，林清芷为一品诰命夫人，李策为户部侍郎，秦昭云为骠骑将军。望诸位日后继续为我大明效力，保我大明江山永固！”
凌风等人纷纷跪地谢恩。经此一役，大明朝堂焕然一新，凌风等人也深知，未来的路依然充满挑战，但他们将携手共进，为守护大明而不懈努力……
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