量子灵魂熔炉崩塌后的宇宙，仍在余震中痛苦呻吟。破碎的星云如伤口般蔓延，超新星爆发的余晖尚未散尽，却被一道尖锐的警报声撕裂。阿笠博士实验室里，灰原哀正在整理残留的量子数据，银灰色的发丝垂落眼前，突然被监测网络的刺目红光染成血色。不同于以往单一频率的预警，这次的警报声如同无数齿轮在时空深处卡壳，发出令人牙酸的金属摩擦声，仿佛整个宇宙的量子态都在发出悲鸣。
全息投影中的星系图谱突然扭曲变形，原本恢复平静的星轨上，无数银色的三角矩阵如癌细胞般扩散。它们以斐波那契数列的精密规律排列，每个矩阵边缘都流转着诡异的虹光，所到之处，空间结构如同被无形剪刀裁剪，出现整齐的裂痕。这些裂痕中渗出暗紫色的能量雾霭，所过之处，恒星的光芒被尽数吞噬，行星像脆弱的玻璃般脆裂成量子尘埃。
“这是‘量子终焉矩阵’。”灰原哀的声音沙哑，额角渗出冷汗。她颤抖着将量子显微镜对准其中一个矩阵，镜中显现出黑衣组织特有的紫色符文在高速旋转，符文的排列方式与母亲遗留笔记中的禁忌符号完全吻合，“这些矩阵正在构建维度归零场，一旦完成，所有平行世界将被压缩成单一的量子奇点。现实、记忆、情感……一切都会回归虚无。”
话音未落，实验室的照明系统开始剧烈闪烁，白炽灯在明暗交替中发出爆裂的声响。墙壁上的电子设备屏幕同时显示出相同的倒计时：07:59:59。红色的数字每跳动一次，都像是死神的鼓点。灰原哀的实验服被突然产生的量子风吹得猎猎作响，她死死盯着不断收缩的时间，指节因用力而泛白。
与此同时，现实世界陷入了前所未有的混乱。纽约曼哈顿的摩天大楼开始以非欧几何的形态扭曲，玻璃幕墙折射出无数个重叠的城市残影。行人惊恐地发现自己的身体正在分裂成多个维度的投影，有人的左手留在三维空间，右手却已陷入四维的褶皱。尼罗河畔的金字塔突然发出刺耳的量子脉冲，将方圆百里的时间流速降低到万分之一。骆驼的脚步变得比蜗牛更缓慢，扬起的沙尘在空中凝固成金色的雾霭。
而在米花市，天空中浮现出巨大的量子棋盘，每颗棋子都是一个被困住的意识体。少年侦探团紧急联络时，元太的声音带着哭腔从侦探徽章中传来：“柯南！街道上的人和建筑都在变成透明的棋子！步美她……她的身体已经开始变得透明了！”背景音里传来玻璃破碎的声音，光彦焦急的呼喊声淹没在尖锐的量子噪音中。
柯南握紧侦探徽章，却惊恐地发现徽章表面的纹路竟开始逆向生长，金属质地逐渐变得如同流动的水银。“他们这次的目标是彻底抹除所有可能性。”他望着自己逐渐透明的手掌，仿佛能看见皮肤下跳动的量子脉络，“我们必须在归零场启动前找到矩阵核心。”
两人乘坐经过量子拓扑改造的穿梭舰，舰体表面流动的银色纹路与终焉矩阵产生诡异共鸣，仿佛随时会被同化。穿梭舰冲破大气层的瞬间，舷窗外的星空扭曲成克莱因瓶的形状，无数平行世界的残影在眼前闪过：有的世界中恐龙仍在统治地球，却被量子洪流瞬间分解成基本粒子；有的世界里人类早已移居外星，此刻在归零场中化作发光的量子尘埃。这些画面如同走马灯般在眼前掠过，每一幕都令人不寒而栗。
穿越维度裂隙时，空间的剧痛几乎撕裂两人的意识。灰原哀的监测仪突然发出尖锐啸叫，红色警报灯疯狂闪烁——矩阵核心的位置已确认，位于所有平行世界的“共通原点”，一个被称为“世界卵”的神秘维度。那里的能量强度已超出仪器的测量范围，光是接近，穿梭舰的防护罩就开始发出不堪重负的嗡鸣。
当穿梭舰抵达目的地，一座由纯粹量子能量构成的巨型卵状结构悬浮在虚空中。卵壳表面布满复杂的神经网络，每条脉络都连接着一个平行世界的命运。那些脉络中流淌着幽蓝色的能量流，如同宇宙的血管，输送着毁灭的力量。黑衣组织首领的身影从卵壳裂缝中走出，他的形态不再局限于物质或能量，而是以概率云的形式同时存在于每个角落。他的轮廓在虚空中不断变换，时而化作孩童天真的笑脸，时而变成老人狰狞的面容，每一个形态都散发着令人窒息的压迫感。
“雪莉，名侦探，欢迎见证宇宙的涅盘。”首领的声音如同整个宇宙的低语，在每个维度的角落回荡，“量子终焉矩阵是完美的归零装置，它将把所有错误的可能性、所有软弱的意识，都熔炼成最纯净的量子原料。在新的宇宙里，不会再有反抗，不会再有怜悯。”
随着他的挥手，卵壳表面裂开无数缝隙，释放出黑色的归零能量。那能量如同贪婪的巨蟒，所过之处，穿梭舰的金属结构开始以肉眼可见的速度坍缩成量子点。仪表盘上的指示灯接二连三地熄灭，生命维持系统发出刺耳的警报。
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