林丹汗的投降，预示着漠南蒙古最后一股敌对势力被大明王朝平定。而原本只有八部六十四旗的蒙古自治区的疆域扩大了一倍还多。
为此，明廷在天启七年十月在北京召开了第二次汉蒙会议。
这次，不光原先的八部六十四旗派出了自己的首领，连外喀尔喀部落联盟派出了三名代表。除此之外，还有已经投降的察哈尔八部首领。
首先，明廷明确接纳了察哈尔部八部的投诚。随即册封了八部首领为世袭罔替的郡王。
同时，授予察哈尔部牧民明国人户籍，并将蒙古自治区内的所有蒙古人归纳为蒙古族。
这也是明廷自册封满族之后册封的第二个少数民族名号。
由于此时的自治区有着十六部，管理难度无疑增加了一倍不止，于是在天启八年正月，将自治领十六部合并为了哲里木盟、卓索图盟、昭乌达盟、锡林郭勒盟、乌兰察布盟、伊克昭盟等六盟。
每个盟设置一名汉人盟主，若干名蒙古副盟主。同时将原有的六十四旗与察哈尔众多的小部落合并成了四十九个旗，并册封了若干名世袭罔替的伯爵。
外喀尔喀部落联盟土谢图汗部、札萨克图汗部、车臣部的代表，并没有接受朱由校抛来的橄榄枝，仅仅是代表自己的联盟向大明皇帝表示了善意。而这，最终将会在未来成为大明军队讨伐喀尔喀的借口之一。
最终，投降的林丹汗与其长子额尔孔果洛额哲被明廷下旨处死，其部落资产被其余各部瓜分干净。秦朝时期的传国玉玺也正式落入了大明皇帝朱由校的手中。
整个北方国境的逐渐安稳，最终让明廷于天启八年底前，将奴儿干都司、远东镇、东江镇、辽东镇进行了细微的调整。黑龙江以东，包含了库页岛等大片区域设立了远东省；黑龙江以南，以松花江、嫩江为界，分别设立了黑龙江省、吉林省，以及以辽河为界的辽宁省。
此举，也预示着明廷将加强东北两百万平方公里黑土地的行政管理。同时为了民族大融合，明廷也开始了百年的移民浪潮，将西北诸省的百姓不断的迁徙至那么广域的黑土地上，逐渐稀释以及同化当地的满蒙两族百姓，加快了民族大融合的进程。
......
北方战事平息，接下来自然就是论功行赏了。江夏侯熊廷弼因军功授封世袭罔替的夏国公，正式成为了大明存世的第五位国公，同时也是皇帝朱由校手中册封的第一位世袭罔替的国公。
扎根远东数年，从一个面积仅是一个小港口，人口不到两万的远东发展到如今拥有耕地面积百万亩，人口两百万（百万朝鲜移民）的大省，洪承畴功不可没。被明廷册封为英都伯，并于十二月被派往菲律宾就任总督。
另一位被封赏的便是从新军一小兵成长为远东一名悍将的辛栋，如今的他已经正式就任远东、黑龙江两省总督，成为了东北地区两大封疆大吏之一。
而满桂则就任辽东、吉林、蒙古三省总督。吴克善、吴阿衡、杨嗣昌、 张天麟、王世忠（哈达那拉·克把库）则分别担任新设之内蒙古自治领总督，辽宁省、吉林省、黑龙江省、远东省巡抚。
完成地域整编之后，援辽的十一个近卫师召回京师。
在远东省，留下了三万大军，以李辅明为提督；辽宁省留下两万大军，以马爌为提督；吉林省留下两万大军，以麻承勋为提督；黑龙江省留下了七万大军，以江应诏为提督。蒙古自治领，以蒙人虎大威为提督，重新组建一零一至一零五师等五个骑兵师。
也就是说，明军占领东北四省之后，二十万驻军并未有丝毫的减少，反而还新筹建了五个蒙古骑兵师。
这样的决议一开始就遭受了朝野的一片质疑声，别说百姓不理解，就连朝堂之上的文武百官都十分不理解朱由校的用意。
他们原本认为，平定东北之后，朝廷应该是逐步减少驻军的数量，毕竟山高路远，物资给养运输极为不便，如此之多的驻军，耗费巨大，对于朝廷的财政压力过于庞大。
他们的理解与否，并不影响朱由校的决策。因为只有他知道，不久的将来，远东那只北极熊的兵峰将会抵达远东地区。到那个时候，再从内地调兵谈何容易。他还指望着东北二十万大军能先他们一步，打到北冰洋呢。这也是他不愿意将兵马抽调回内地的根本原因。
而且，他深知，只要合理开发东北四省的黑土地，别说二十万大军了，再多加二十万也并非难事。
此事很快就如此定调下来。
......
天启七年六月初六，广东省广州府，一场鸿大的誓师大会刚刚落幕，南洋舰队那庞大的军舰缓缓的从各港口驶出，他们将在入海口——伶仃洋集合，并在南海等待自福建而来的运输船队。他们此行的目标便是西班牙人手中的吕宋群岛。
为了彰显皇明军威，此次南洋舰队倾巢出动。共计派出四十艘千吨级新锐盖伦船、一百七十六艘次级战船，以及二百六十艘辅助战船的庞大舰队。光海员就达到了的两万七千余人。何况，他们还要护送五百艘大小运输船队两万步兵。
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