晶体技术的突破让联盟的军事力量得到了质的提升，但虚空防线的危机并未解除。铁卫通过监测发现，深渊文明正在防线附近的“黑暗星云”中建立新的能量炼厂，试图通过星云的掩护，再次发起对虚空防线的攻击。“黑暗星云的环境复杂，星云尘埃会干扰我们的探测系统，敌人很可能会在那里设下埋伏。”铁卫向墨分析道。
墨决定亲自带领奇袭队，潜入黑暗星云摧毁敌人的能量炼厂。这一次，奇袭队的装备全部升级为晶生能量版本：星灵战士的铠甲能释放晶生能量护盾，暗影战士的匕首涂有晶生能量毒素，虫群的火焰抗虚空虫能释放晶生火焰，威力比之前提升了三倍。五艘经过改造的“暗影猎手级”潜行舰再次出发，朝着黑暗星云飞去。
黑暗星云内，到处都是漂浮的岩石和能量乱流，能见度不足一公里。潜行舰的探测系统受到严重干扰，只能依靠暗影潜行虫的实时侦查来确定方向。“前方五公里处发现能量反应，应该是敌人的能量炼厂。”卡莎的声音传来，她正通过暗影潜行虫的视野观察前方的情况。
墨通过全息投影看到，一座巨大的能量炼厂隐藏在星云的中心，炼厂的周围部署了二十艘深渊战舰和数千名深渊守卫。炼厂的顶部有一座能量塔，正不断吸收星云的能量，转化为深渊能量储存起来。“敌人的防御很严密，我们需要制定详细的攻击计划。”墨说道。
经过商议，奇袭队制定了声东击西的战术：雷克斯带领虫群战士，驾驶小型穿梭机从正面发起攻击，吸引敌人的注意力；卡莎的暗影小队从侧翼潜入炼厂内部，破坏能量塔的核心装置；莉娜的水晶小队负责破解炼厂的防御系统；墨则带领星灵战士，在炼厂的后方埋伏，阻止敌人的增援部队。
攻击开始后，雷克斯的虫群部队率先发起冲锋，穿梭机的武器系统全力开火，晶生火焰弹落在深渊战舰的甲板上，瞬间将舰体点燃。深渊守卫们立刻围拢过来，雷克斯带领虫群战士跳出穿梭机，晶生能量武器与深渊武器碰撞在一起，发出刺耳的声响。
卡莎的暗影小队趁机潜入炼厂内部。炼厂的通道内布满了深渊能量感应装置，只要有外来能量靠近，就会触发警报。卡莎让暗影战士们释放出微弱的暗影能量，模拟深渊能量的波动，成功避开了感应装置。在炼厂的能量塔底部，她们发现了能量核心装置，装置周围有十名深渊法师正在守护。
“动手！”卡莎一声令下，暗影战士们如同幽灵般冲上去，晶生能量匕首精准地刺向深渊法师的能量核心。深渊法师们猝不及防，瞬间被击杀。卡莎立刻将定时炸弹安装在能量核心上，设定好爆炸时间后，带领小队迅速撤离。
莉娜的水晶小队则成功破解了炼厂的防御系统，将炼厂的能量护盾关闭。墨带领的星灵战士抓住机会，从后方发起攻击，晶体主炮的晶生能量光束将增援的深渊战舰逐一摧毁。当奇袭队的所有成员都撤离到安全区域时，定时炸弹准时爆炸，能量塔瞬间坍塌，整个能量炼厂被巨大的爆炸吞噬。
摧毁能量炼厂后，奇袭队在返回晶体行星的途中，遭遇了深渊文明的追击舰队。二十艘深渊战舰从星云的另一侧冲出，朝着潜行舰追来。“启动晶生能量加速装置！”墨下令，潜行舰的引擎释放出强大的晶生能量，速度瞬间提升了两倍，逐渐拉开了与追击舰队的距离。
但深渊战舰的速度也很快，眼看就要追上。凯伦建议道：“我们可以利用星云的能量乱流，设置陷阱。”墨采纳了她的建议，让潜行舰释放出大量的晶体能量诱饵，这些诱饵能模拟潜行舰的能量反应。深渊战舰果然上当，朝着能量诱饵追去，最终陷入了能量乱流中，被乱流撕碎。
奇袭队成功返回晶体行星后，受到了联盟成员的热烈欢迎。摧毁黑暗星云的能量炼厂，不仅解除了虚空防线的危机，还获取了大量的深渊能量数据，为联盟的武器研发提供了重要参考。莉娜根据这次行动中收集到的资料，进一步完善了晶生能量技术，研发出一种能将深渊能量转化为晶生能量的装置——“能量转化器”。
这种装置的出现，彻底改变了联盟的能源结构。联盟不再需要依赖有限的水晶之心碎片，而是可以将战场上的深渊能量转化为可用的能源，实现了能源的可持续利用。李林在得知这一消息后，兴奋地说道：“晶生能量技术的突破，让我们在与深渊文明的战争中，占据了主动权。”
但好景不长，跨域情报总局传来了坏消息。卡莎向李林和墨汇报：“根据暗影主文明提供的情报，深渊之主已经与虚空恶魔族达成协议，虚空恶魔族将派出十支‘虚空舰队’支援深渊文明，预计三个月后抵达跨域联盟的疆域。虚空舰队的战舰能吞噬晶体能量，普通的晶生能量武器对其无效。”
墨和李林的脸色都变得凝重起来。虚空恶魔族的实力远超他们的想象，一旦虚空舰队抵达，联盟的防线很可能会被瞬间突破。“我们必须在三个月内，研发出能对抗虚空恶魔族的武器。”墨说道，“莉娜，你带领各文明的顶尖学者，立刻成立‘反虚空武器研发小组’，务必在虚空舰队抵达前，研发出有效的对抗武器。”
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